この研究は、研究者が古代に発芽した種子の植物のゲノムをシーケンスしたのは初めてです。
Nyu Abu Dhabiのゲノミクスおよびシステム生物学センターの研究者は、2、000年以上前に住んでいた以前に絶滅した日付の手のひら品種のゲノムをうまく配列決定しました。彼らは、紀元前4世紀から西暦2世紀までの放射性炭素時代に、南レバント地域の考古学的な場所から回収された日付のヤシの種子を使用してそうしました。種子は発芽して、生存可能な新しい植物を生成しました。研究者は、これらの発芽した古代サンプルの全ゲノムシーケンスを実施し、このゲノムデータを使用して、これらの以前に絶滅したユダヤ人の日付の手のひらの遺伝学を調べました。この研究は、研究者が古代に発芽した種子の植物のゲノムをシーケンスしたのは初めてです。
aのゲノムを調べることにより種（Phoenix dactylifera L.）何世紀も前に繁栄した生物学教授のマイケル・D・プルーグガンと彼のニュアドの同僚は、イスラエルとフランスの研究パートナーとともに、これらの植物が一定期間にわたってどのように進化したかを見ることができました。この場合、彼らは、紀元前4世紀から西暦2世紀の間に、東地中海のデートの手のひらが別の種であるフェニックステオフラスティからの遺伝子のレベルの増加を示し始めたことを観察しました。彼らは、この期間にわたってP. Theophrastiからの遺伝子のレベルの増加は、東地中海におけるローマ帝国の影響の増加を示していると結論付けています。
彼らの発見は、ジャーナルに掲載された「2、000年前の種子から発芽した古代の手のひらのゲノム」で報告されています国立科学アカデミーの議事録アメリカ合衆国。
「私たちは幸運にも、パームシードが長い間、この場合は2、000年以上生きることができ、最小限で発芽しますDNAPurugganan氏は、「この地域の乾燥環境での損傷」は、「この「復活ゲノミクス」アプローチは、ユダヤの日付の手のひらのような過去およびおそらく絶滅した種の遺伝学と進化を研究するための非常に効果的な方法です。考古学的、古生物学的サイト、または歴史的コレクションから古代の種子を発芽させるなどの生物学的材料を復活させることにより、失われた集団のゲノムだけでなく、場合によっては、現代の品種で絶滅した可能性のある遺伝子を再発見することもできます。」
参照：「2、000年前の種子から発芽した古代の手のひらのゲノム」、ムリエル・グロス・バルタザード、ジョナサン・M・フラワー、カレド・M・ハッツーリ、シルビー・フェランド、フレデリケ・アバレンス、サラ・サロン、マイケル・D・プルガナン、2021年5月3日国立科学アカデミーの議事録。
doi：10.1073/pnas.2025337118
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